| Állattenyésztési Tudományok Doktori Iskola | állattenyésztési tudományok |
| Egészségtudományok Doktori Iskola | egészségtudományok |
| Fizikai Tudományok Doktori Iskola | fizikai tudományok |
| Fogorvostudományi Doktori Iskola | klinikai orvostudományok |
| Földtudományok Doktori Iskola | földtudományok |
| Gyógyszerészeti Tudományok Doktori Iskola | gyógyszerészeti tudományok |
| Humán Tudományok Doktori Iskola | filozófiai tudományok,neveléstudományok,pszichológiai tudományok,szociológiai tudományok |
| Idegtudományi Doktori iskola | elméleti orvostudományok, klinikai orvostudományok |
| Ihrig Károly Gazdálkodás- és Szervezéstudományok Doktori Iskola | gazdálkodás- és szervezéstudományok |
| Informatikai Tudományok Doktori Iskola | informatikai tudományok |
| Irodalom- és Kultúratudományok Doktori Iskola | irodalom- és kultúratudományok |
| Juhász-Nagy Pál Doktori Iskola | biológiai tudományok, környezettudományok |
| Kémia Doktori Iskola | kémiai tudományok |
| Kerpely Kálmán Doktori Iskola | növénytermesztési és kertészeti tudományok |
| Klinikai orvostudományok doktori iskola | klinikai orvostudományok |
| Laki Kálmán Doktori Iskola | elméleti orvostudományok,klinikai orvostudományok |
| Marton Géza Állam- és Jogtudományi Doktori Iskola | állam- és jogtudományok |
| Matematika- és Számítástudományok Doktori Iskola | matematika- és számítástudományok |
| Molekuláris Orvostudomány Doktori Iskola | elméleti orvostudományok |
| Molekuláris sejt- és immunbiológia Doktori Iskola | elméleti orvostudományok |
| Nyelvtudományok Doktori Iskola | nyelvtudományok |
| Petrányi Gyula Klinikai Immunológiai és Allergológiai Doktori Iskola | klinikai orvostudományok |
| Táplálkozás- és Élelmiszertudományi Doktori Iskola | egészségtudományok, élelmiszertudományok |
| Történelmi és Néprajzi Doktori Iskola | néprajz- és kulturális antropológia,t örténelemtudományok |
